Après la mort du premier Évêque, les travaux subissent un ralentissement dû à un manque de fonds, jusqu’à l’intervention décisive de Marie Madeleine d’Autriche, épouse de Cosme II de Médicis, à laquelle est confié le gouvernement de la ville. Ainsi le toit est fini en 1619, tout en réduisant le nombre de travées par rapport aux cinq prévues dans le projet initial. Le maître-autel est aussi édifié.  Cosimo della Gherardesca, le second Évêque, fournit l’ameublement et les objets liturgiques, de façon à pouvoir célébrer solennellement, le premier juillet 1630, la fête du Saint patron Martial, bien que l’Église soit encore limitée à la zone près du transept et de l’autel. Le 5 Novembre 1632 l’Évêque Cosimo bénit la première pierre du nouveau clocher, inachevé, à côté duquel encore aujourd’hui se trouve l’entrée de l’ancienne chapelle utilisée comme Baptistère, sur le côté gauche de la Cathédrale. En outre on peut voir ici la façade de l’ancienne pieve de San Salvatore. Sur le côté droit, au contraire, se trouve l’entrée de la crypte, sous le pavement de l’église; elle contient trois autels et des peintures murales, et est fréquentée par la Confrérie de la Miséricorde, d’où son nom.  Le troisième dimanche d’Octobre 1658, le sixièmes Évêque de Colle Giovan Battista Buonaccorsi effectue la . . .