Es el punto más importante del edificio eclesiástico, lugar donde se recuerda el sacrificio de Cristo. El señor se dona con su cuerpo y su sangre conservados en el tabernáculo. El altar mayor fue construido en mármol, se encuentra un poco sobreelevado respecto a la nave con la finalidad de que todos los fieles lo pudieran ver. Fue realizado por el escultor Flaminio Del Turco en 1608 por voluntad del noble senés Cristófano Chigi. En él, se pueden observar dos figuras alegóricas, obras del escultor Fulvio Signorini, que representan la Caridad, la cual lleva en sus brazos a dos niños y la Fe que lleva en la mano izquierda una cruz y en la derecha un caliz con la hostia consagrada. Arriba del altar se encuentra el imponente tabernáculo como indicado en las “Ordinationes” de los Eremitas de San Agustín escritas en el tiempo del Papa Alejandro IV que establecian que en todas las iglesias de la Orden, el Cuerpo de Cristo tenía que estar protegido en un tabernáculo colocado arriba del altar mayor. Esta obra fue realizada a finales del siglo XVII por los escultores seneses Mazzuoli y fue enriquecida con dos ángeles ceriferarios que miran hacia la imagen de Cristo resucitado. Debajo de los pequeños peldaños de la mesa del altar se puede observar la puerta del tabernáculo con la incisión del caliz eucarístico realizada contemporaneamente al altar. Abajo de la mesa, al . . .