Detrás del altar mayor, se encuentra el coro y dos maravillosos órganos laterales obras de dos artistas seneses que completan los objetos de madera de la Colegiata realizados por el arquitecto Agostino Fantastici (1782 – 1845) utilizando el estilo neoclásico.
Su modo de concebir el espacio, lo estímula a la creación de bancos, confesionarios y reclinatorios. Se habla del Fantastici como  un grande intérprete del gusto artístico de su tiempo y para esta iglesia propone una decoración de objetos en línea con la moda de la época añadiendo también su idea personal  de gusto ornamental. Un sobrio mobiliario donde los distintos tipos de madera (nogal y ciprés) dan distintos volumes y particulares efectos cromáticos.
Otros objetos importantes que se encuentran en el altar mayor  son un gran brocado de terciopelo con los símbolos del papa, donado a la Vírgen el 8 de junio de 1658 por el Papa Alejandro VII  Chigi y otro es una bandera turca donada a la Virgen de Provenzano en 1686.