Chaque élément décoratif présent à l’intérieur d’une église est là pour une raison précise, aider à rapprocher l’homme de Dieu : le choix des sujets ou épisodes représentés sur les toiles, les statues des autels, les décorations des pavements, les éléments décoratifs de la façade, chaque élément a le but précis de fournir un secours à qui entre dans l’église pour prier et rencontrer Dieu.
Même la lumière joue un rôle important. La lumière assume symboliquement la signification de présence de Dieu; en effet, Jésus a dit: «Moi, je suis la lumière du monde, celui qui me suit ne marchera pas dans les ténèbres, mais il aura la lumière de la vie.» (Jn 8, 12) Celui qui vit de cette lumière, qui est Dieu, devient lumière à son tour pour tous les autres, c’est à dire, grâce à son témoignage, il devient le moyen à travers lequel Dieu se manifeste. En effet Jésus a dit: “Vous êtes, vous, la lumière du monde.” “Qu’ainsi brille votre lumière devant les hommes, afin qu’ils voient vos belles œuvres et glorifient votre Père qui est dans les cieux.” (Mt 5, 14 et16)
Pour cette raison les vitraux contribuent à créer une ambiance favorable au recueillement, au silence et à la prière. En filtrant la lumière, ils produisent des jeux de faisceaux lumineux colorés continuels, qui changent selon la position du soleil et de l’heure de la journée : nous vous invitons à entrer dans l’église le matin, au soleil couchant et le soir; vous vous rendrez compte de comment le changement de la lumière peut transformer profondément l’intérieur de l’édifice, au point de le rendre différent d’heure en heure.
L’entrée de la lumière est étudiée dans les moindres détails : le matin la lumière pénètre avec vigueur, car elle se rappelle de louer Dieu pour le jour nouveau qui commence, au soleil couchant la lumière devient plus douce pour accompagner un moment de réflexion sur le temps qui passe. Pour déchiffrer les personnages d’un vitrail il faut beaucoup d’attention car tous les éléments sont composés de petites pièces de verre colorés montés sur un support en bois ou en plomb, et pour cette raison d’une lecture difficile.
A l’intérieur de cet édifice, les vitraux représentent surtout des Saints et Bienheureux, c’est à dire des personnes qui par leur vie et leur exemple peuvent aider le fidèle qui prie.
En outre on y voit des épisodes fondamentaux de la vie de saint François d’Assise et des Saints franciscains; en particulier, dans la splendide fenêtre bigéminée, saint François reçoit, en 1223, l’approbation de la Règle dans la basilique de saint Jean de Latran à Rome, du Pape Honoré III. Ici sont présents deux éléments fondamentaux du charisme de saint François : l’Église, c’est à dire le peuple de Dieu, guidé par le représentant du Christ sur terre, le Pape, qui peut vivre dans la bonne voie seulement s’il se base sur la Parole, contenue dans la Bible portée par un Évêque. Il n’y a pas de salut hors de l’Église et sans la Parole de Dieu.