Sainte Catherine fut baptisée dans le Baptistère de Saint Jean, comme tous les siennois pendant des siècles. Ce lieu a un rôle très important, étant donné qu’à travers le Baptême, est établie l’appartenance des chrétiens à l’Eglise universelle et en même temps à la communauté locale: en plus du symbole de la renaissance dans le Christ, les fonts baptismaux sont aussi un signe de l’identité collective. Par rapport à la structure habituelle des Baptistères, celui de Sienne a des caratéristiques bien particulières. Tout d’abord par sa position, adossé à la partie postérieure de la Cathédrale au lieu de se trouver devant. Toutefois, il réussit à transmettre la fonction symbolique d’accès à l’Eglise, sa façade étant tournée vers le centre vitale de la ville.
Le Baptistère n’a pas la traditionnelle structure à plan octogonale, forme qui exprime la participation du baptisé à la résurrection du Christ, survenue le premier jour après le samedi, c’est à dire le huitième jour; l’édifice est en effet rectangulaire, divisé en trois nefs couvertes de voûtes en arêtes. Deux éléments attestent que ce lieu est un Baptistère: les fonts baptismaux, merveilleuse synthèse de la sculpture toscane du XVème siècle et la décoration à fresques des voûtes qui illustre les phrases du Credo renfermant la profession de foi demandée pour l’admission au Baptême.